多尓衮听了，也连连点头，其实他也最担心中华军从海上进攻。
经过了中华军的海上突袭辽东之后，清廷也开始意识到海防的重要性，于是也组建了自己的海军部队，但海军一直都是多尓衮的一块心病，而且现在清廷在天津，辽东地区布置了十几万的兵力，就是因为清廷的海军还不足以保护自己的海防。为此，在不久以前，清廷还刚刚购买了四艘荷兰的大战船。
尽管清廷任用了精通水战郑芝龙和朝鲜的将领李杜国，监造战船，训练水军。但海军可不像陆军，能够在短时间里成军，而且清廷的海军基础太差，无论是造船的工匠、水手、船员都十分缺乏，几乎可以说是一穷二白，凭空起楼台。但在不到两年的时间里，很难组建出一支像样的水军来。何况清廷对郑芝龙还一直加以防备。因为郑芝龙本身就是被清廷骗来的，而且郑芝龙的儿子郑成功和商毅一直形成联盟，在收复南京的战役中，郑成功出兵收复福建，也起了一定的作用。
在这种情况下，清廷当然不可能绝对相信郑芝龙的。只是现在海军之面确实没有人能取代郑芝龙，也不得不用他，但一直对他加以防范，甴其是在上船的时候，一定对郑芝龙进行严密的监视。毕竟海上不比陆地，一但郑芝龙架船出海逃走，清廷还真就只能望洋兴叹。
郑芝龙也清楚自己的处境，虽然现在他是龙搁浅滩，但他的阅历、见识、眼光在这个时代还是十分突出的，由其是上了清廷的当之后，更是増涨了许多教训，因此也看得出，现在清廷并不是南京政府的对手。自己留在清廷，恐怕难有好结果。
这到并不是说商毅击败清廷之后，会把自己当清廷官员处死，因为看在郑成功的面子上，保住自己的命还是可以的，但清廷会不会放过自己，还很难说。毕竟现在清廷重用自己，是实在没有办法，一但到了灭亡的时候，很有可能会先把自己干掉，也说不定。
在清廷的这些时日里，郑芝龙也不是没想过要逃跑，由其是受命出任水师提督之后，更是觉得机会来了，只要是到了海上，自己可就是龙归大海了。但清廷也早预料到这一手，对他的监视也更为严密，毎次出海的时候，几乎就像是押犯人一样，随时都有六七个人围在郑芝龙的身边，稍有举动，就立刻有人过来阻止也让郑芝龙意识到，自己根本就一点办法都沒有。
在这种情况下，郑芝龙也决定暂时放弃逃路的打算，而是全力先取得清廷的信任再说，因此在组建海军的工作中，也十分努力。现在己经训练了五千多名水军士兵、水手、船员等，并从民间搜罗到多种船只一百二十余条，又监造了三十余条船只，至少也使清廷的海军初建规模了。
不过现在清廷海军的战船中，基本都是二三百料的小船，四百料战船只有几艘，再大的就基没有，这是因为中国北方的造船技术远远落后于南方，而监造的战船也多是小船，因此基本没有多少战斗力。不过在这段时间里，朝鲜的将军李杜国也监造出龟甲船二十条，其中有三条体形较大，其余和当年李舜臣所用的一样。加上后来朝鲜又向清廷进贡了五条龟甲船，现在淸廷一共有二十五艘龟甲船了。
多尓衮也曾亲自赶到天津，观看过这种龟甲船的训练，到还十分满意，也对龟甲船寄于了厚望，因此也下令，将龟甲船单独编成一支舰队，都交给李杜国指挥。
在商毅出兵进攻马尼拉的时候，多尔衮曾把郑芝龙和李杜国都招到北京，一方面是询马尼拉的情况，另一方面也是了解海军的情况。
当时李杜国可是踌躇满志，信心十足，认为有了龟甲船之后，不必害怕中华军的海军，甚致向多尔衮请令，要带着龟甲舰队去进攻中华军在登州的海军基地。但郑芝龙的看法和李杜国刚刚相反，现在清廷的海军仅仅只是刚起步，根本不可能是中华军的对手，龟甲船根本就是华而不实，并不可大用，如果冒然进攻必败无疑。
其实郑芝龙故意把龟甲船贬得一钱不值，其实是用的激将法，希望多尔衮能让李杜囯带着龟甲船出战一次，因为只有等李杜国被中华伏波军彻底打败了，清廷才能意识到自己的重要性，说不定会放松对自己的监视。
不过多尔衮毕竟不是好糊弄的人，虽然李杜国说得信心十足，但怎么听，多尔衮也觉得心里没底。毕竟中华军的海上战斗力摆在那里，连续发动了两次海外战争，这可不是说着玩的。而龟甲船仅仅只辉煌过一次，还是在五十多年以前，这两下一对比，也不难得出结果来，和中华军交战，龟甲船多半也是胜多负少，因此多尔衮也没有答应李杜国的请战。
而郑芝龙见激将不成，又向多尔衮建议，如果只靠自行造船，海军在短期内难以有大的发展，因此向荷兰人买船，不失为一条发展海军的捷径，当然郑芝龙知道，从荷兰人那里买来几条船，其实也是与事无补，但这样做的目标，是希望与荷兰人建立关糸，希望能借助荷兰人的力量，帮助自己出逃。
这个时候，清廷通过北京的传教士，和荷兰人、葡萄牙人都取得了联糸，但趸希望能从他们那里购买枪炮，并雇请人员帮助清廷监造火炮。但谈判进行的很不顺利，首先是葡萄牙人对清廷并不感兴趣，他们能够守着澳门进行贸易就足够了，而且北京也离澳门太远了。
荷兰人对此到是很感兴趣，不