忍者学校的生涯中，虽然有了一点小插曲，但并没有给索伦的生活带来一丝改变，依旧保持着木叶忍者村和日向家大宅之间的两点一丝，没有引发半点波澜。至于那位云隐村的间谍渡边三桥，只是让索伦在自家的心中记下了这个人而已，并没有想要用他做出任何地文章。
如果索伦还是一个忍者，还是一个属于木叶的忍者。那他应该将渡边三桥的身份挖出来，以免让他的作为会给木叶村带来巨大的损失。但此时的他，却完全没有那个心情去理会，甚至都没有在渡边三桥身上投入太多的注意力，只是装作了一个标准而又普通的“天才学生”。
大约过了半个月左右，木叶村的气氛已经渐渐平稳下来，被摧毁的房屋开始进行重建，历代火影的新雕像也开始重新制作，村子里的紧张气氛终于稍稍舒缓了几分之后，索伦才在忍者学校放学之后，悄然前往已经荒废的宇智波一族的族宅，进入了一个很是偏僻的小屋里面，然后他在小屋的墙壁是那个摸索几下之后，便出现了“咔嚓”一声，从貌似平常的墙壁上面开出了一个五尺上下的大洞，露出了不断向下延伸的台阶。
“霍霍，真是好久没有回到这里的。我的……实验室！”
索伦沿着楼梯，走到了这间屋子的最底部之后，脸上露出了一抹怀念之色，低声叹息道。
在索伦“生前”尚且还是一个木叶忍者，宇智波家族的“明日之星”的时候，这个地方算是索伦手中的一张“底牌”，是他除了那双万花筒写轮眼之外的最大秘密。当年的他之所以敢于拼死一搏，用那种不惜以自己的“肉身”为祭品的方式去成就属于的“黄泉比良坂”，其实也并非是他太过鲁莽，而是他进行了反复的“验证”的结果。
在这个实验室里面，密密麻麻地摆放着上百个“水箱”。在每个水箱里面，都有漂浮着一些形状千奇百怪的小动物的尸体，动物（人）的肉块，器官。如果有外人来到这里，甚至还会骇然的发现，这些水箱里面居然还有两对写轮眼，一只白眼，以及来自于初代火影的细胞，宇智波一族的族人的血液，以及属于雾隐的尾兽“六尾”犀犬的一根触手，以及来自于“九尾人柱力”，“阿修罗转世”的漩涡鸣人和“宇智波一族遗孤”，“因陀罗转世”的宇智波佐助的体细胞和血液细胞。
这些东西，都是索伦从九尾之乱的那一夜开始到宇智波一族覆灭的那一段时间里面收集到的“战利品”。这些东西，有的来的光明正大，有的用了些龌龊手段。譬如说，他获得的那颗“白眼”和“六尾”犀犬的触手都是来自于他的一次前往雾隐村的任务的战利品，千手柱间的细胞从从志村团藏的收藏品中偷窃到的。那双写轮眼则来自于两个死在某次任务中的宇智波一族的族人。在当年的时候，索伦可不知道自己的未来能达到今日这般的程度，每日想的只是如何增强实力，如何从灭族之夜生存下去而已。因此在他明面上装成一个相对比较出色的宇智波的同时，也不得不在暗地里面做出一些安排，进行一些禁忌的研究和实验。
因为索伦当初隐藏的很好，并且每次出手的时候也很小心，所以一直到现在，这个实验室都没有被发现。不然若是让木叶村的忍者见到了这个充满着邪恶气息的实验室，那么他们怕是会立即将索伦打为叛忍，立即喊打喊杀了。
“哎，我那个时候！还是太单纯了！这种充满荒唐气息的实验，竟然做的那般津津有味。”
索伦抚摸着那个存放了初代目火影的肌肉组织的水箱，脸上露出一抹怀念的神情，低声说道。
这实验看上去阴森，恐怖，充满着“科学怪人”的味道。但认真说起来，这其实也就是一个只有一星半点的科学素养的笨蛋在基于一些没有首尾的情报和一些来自于同人小说中的古怪猜想而弄出来的一个大杂烩而已。
在最初的时候，索伦的目的其实是模仿前世的“克隆技术”，希望能够以自己的体细胞为材料，复制出一批“写轮眼”。但是在他经过一段时间的研究，并且利用“查克拉”这种极不科学的能量去刺激细胞，融合细胞之后，完成了那个实验之后。却发现他的这种做法，只能制造出干净存粹的的“眼睛”，却制造不出那种只有让宇智波一族明悟何为“爱”之后才能获得的血继界限——写轮眼。他的那一番辛苦，其实没有半点价值。
克隆实验失败之后，索伦还试着提取水母，壁虎，海参等生命力顽强，能够做到“断肢再生”的动物的细胞，试图能够用他们为原料，制造出一种能够让人在战斗的时候能够断肢重生，达到纲手所研发出的忍术“创造再生”的效果一般无二的“全能药剂”。但是在他经过一番试验之后，发现自己的这种想法只是想当然而已。
虽然索伦的那些试验并非全然无效，也是有成功案例的。在大约七八年前的时候，索伦便曾经试着用培养基去培养那些来自于千手柱间的细胞，让这些细胞不断地增殖，繁衍，使得这些细胞不断地退化，削弱柱间细胞的生命力和感染性，然后再将这些细胞做成药剂，注入到自己的体内，以此去壮大自己的生命力，让他能够长时间的运用那双属于自己的“万花筒写轮眼”，而不会因此而失明，但是总体而言，却还是失败的多，成功的少，甚至有时候就算真的成功了，也只是制造出了一些没