杜文秀这厮，确实是个人才！
这是吴可了解了云南之前的变故后，心中涌起的奇妙想法。
当时他还在淮北坐镇，四处绞杀流寇开垦荒地，大部分注意力被两江战事以及太平军吸引，根本就不知道云南还有这么一位强人。
确实是强人，当时整个大清的起义武装中只有太平军建立政权，被视为朝廷之心腹大患。那时节捻匪气势也是极盛，拥兵数十万纵横河南山东以及周围省份，气焰嚣张却只知流动作战没有一个牢固根据地。
没想到屈居边陲的回民首领却有此等格局，只要好好经营大理再打上几个胜仗，说不定就有了一番气象，就算比不得太平天国但其存活能力将比捻匪更强。
当时由广东天地会残余武装组建的大成国还没建立，而且大成国建立以来在军政以及民政两方面的建树比之杜文秀差了不少，不然也不会那么轻易就被两广清军搞定。
果然没出他所料，杜文秀这厮在云南开创一番局面。
大理背靠苍山，面向洱海，以上下两关为咽喉，地势极为险要。以杜文秀为首领的大理政权建立之后，这厮领导所部人马利用良好的地理条件，修营筑垒屯集粮草，做好了防御云南清军进攻的准备。
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当时的情况对于杜文秀政权十分有利，朝廷正在全力围剿太平军，两江，亮广还有闽浙烽火连天，全国各地的绿营清纷纷来援，云南清军自然没能例外，导致云南境内清军数量稀少战力不强，给了杜文秀等武装力量宝贵之极的发展时间。在云南清军千总张正泰率兵来犯失败之后，清军又多次组织力量向大理进攻。
宾川团练首领董家兰和太和县逃亡地主豪绅赵云寿、李根香等人组织“义兴营”团练军，联合败退到鹤庆的张正泰和屯扎姚州的提督文祥所部清军，企图摧毁杜文秀部控制的大理政权。
1857年夏，文祥指挥清军进攻下关东面的赵州。时值滇东、滇南回民武装力量围攻昆明，滇西杜文秀部乘机袭击文祥部后路。文祥部清军腹背受敌溃不成军，文祥退回镇南州今南华），弥渡和云南县今祥云）为杜文秀部人马占领。
1859年2月，董家兰指挥“兴义营”团练军，水陆两路对大理发动突然袭击。潜伏在大理城下的数百名练勇利用夜暗，用棺木装火药将城墙炸开，夺占了东门城楼，但从洱海进攻的团练主力因遇到大风浪，未能按期到达以致对大理的袭击又遭失败。
不久，董家兰因援邓川今洱源东南）被杜文秀部击毙，张正泰亦因内讧被部下杀死。张董二人既死所部团练军一蹶不振，陆续被大理城杜文秀部消灭。于是滇西回民武装声势大振，乘机向四外大肆扩张。
因为在杜文秀手上连战连败，以致官府“是时无敢言复大理者”.
因清军屡败新任云贵总督于1860年1月奏请以总兵褚克昌署理云南提督，办理滇西军务。之后褚克昌率兵西上，经禄丰、楚雄，于3月间至镇南州，接任提督职务。他一面分兵进攻杜文秀部占据的姚州、大姚，一面率主力继续西进。
杜文秀眼见清军气势太盛大急忙收缩兵力，主动放弃沙桥镇南西北）、云南驿云南县东南）等据点，退守易守难攻的大理县城。褚克昌率军尾追至大理县城下，指挥所部清军进攻县城和弥渡、红岩弥渡西北）等地。
面对褚克昌部清军的大举进攻，杜文秀一面派人发动滇东、滇南回、汉、彝各族百姓帮忙以牵制清军，一面催调正在进攻缅宁今临沧）的大都督蔡法春率军回援，同时致书澂江的马德新部，请求派兵支援配合，以切断褚克昌部的后路，行成东西夹击的态势。
……
1858年，滇东、滇南回民武装力量从昆明撤围散归各地之后，当时的云南巡抚即调集清军向回民进攻，回民被迫起而自卫。马德新、马如龙因个人目的没有得到满足，也乘机再次起兵，于是滇东、滇南回民武装力量又得到了发展。
1860年春，马如龙受马德新之命，率部西援杜文秀，4月底与李芳园部会合，共万余人，由南安州直逼楚雄。回民武装联军于5月3日攻克广通，5日在回镫关广通西南）大败楚雄清军来援人马，击毙清军游击高天泽。
8日，又在小腰站歼灭楚雄清军千余人，击毙千总苏镇东。“楚雄得力将弁，无出高天泽、苏镇东右者，相继败没，兵勇夺气。”5月21日滇东、滇南回民武装包围了楚雄府城。
楚雄清军连败两仗、士气低落的楚雄清军人马无力阻挡回民武装的锐利攻势，楚雄知府杨觐向署理提督褚克昌求救。褚克昌正在进攻弥渡、红岩，无兵可派，只得尽撤镇南大营清兵赴援楚雄。
6月5日，褚克昌率军亲抵楚雄府城，马如龙、李芳园指挥回民武装力量昼夜围攻，于6月11日用地雷轰塌城垣二十余丈攻入城内。城中清军一部投降大部被歼。知府杨觐、副将庆连等被打死，褚克昌见机得快逃往镇南。
回民武装联军攻占楚雄，不但切断了楚雄清军的后路，而且由于清军官兵的父母妻子多寓居楚雄，以致前线军心瓦解无意作战。尽管褚克昌部将杨有才、张玉柱所部清军攻占了弥渡和红岩，却无法摆脱这种不利的困境。
而此时滇西回民武装又从西面发动了强大的攻势，使清军腹背受敌更形狼狈。大理回军大都督蔡法春于1860年4月底攻陷缅宁后，即率领云州、顺宁、蒙化