解除网络进化的暴君天使兽x·混沌形态失去了几乎所有的活动能力，这种情况下，保留数码兽形态只剩下威慑作用。
网路大炮击穿虚拟层天空带来了一个彩羽尼奥意想不到的问题——极少数数码兽会通过网络大炮被卷入网络世界，继而获得进入人类世界的机会！为了修复网络大炮给数码世界造成的创伤，奈奈美强迫美树原诺伦与黑日女神进行组合，成为暴君国度的主机级人工智能。这样她就有能力对虚拟层的天空进行修复。用伊芙限制美树原诺伦，也能防止她获得力量后背叛暴君国度。
即便如此，单纯的天空仍然防不住网络大炮，紫色光柱依然在数码世界的大地上横行，但其威力已经削弱到了极点。起码，被外围扫中不再会有致命的危险。究竟是网路大炮的威力更强，还是天空的防御力更高，就是双方不断升级的过程。
最终在多尔芬与卡罗等一批科学家的研究下，在顽固兽的指导下，他们找到了一种将陆峰的精神从暴君天使兽x·混沌形态中剥离出来的方法。这就像当初濒临死亡的木村辉一一样，是纯粹的精神化身，但其进步之处在于，这个精神化身即使进入人类世界，也能借助物质离子化形成特异蛋白来构建身体。也就是所陆峰进入人类世界后所使用的身体本质上与数码兽所只用的身体是一样，是人形数码兽，而非完全的人类。
之所以要这么做，是因为陆峰判断数码宝贝第三部的剧情很可能要开始了——挂在天上的那个绿色球体和紫色光柱实在是太显眼了！陆峰不能确定第三部的故事被扭曲到了什么程度，但大致上肯定是符合动画剧情的。他不愿借其他人之手去关注松田启人的成长，穿越的事情更是秘密中的秘密。更何况，陆峰记得很清楚，之后的网络管理局会有一个“歼灭计划”，其与这次的网路大炮会有什么关系也很难说——山木满雄所获得技术与对数码兽的了解远远超过动画中，区区朱雀兽能否阻止他真的很难说……
平野小学，是大阪教育大学的附属小学，松田启人就在这里就读五年级。因为东京变成第三东京市，原先的淀桥小学自然不存在了。不过班主任浅沼奈美仍然是松田启人的老师，原来的校长黑泽清二成了平野小学的副校长。盐田博和、北川健太、加藤树莉也都一一就位，这就是所谓的剧情惯性吧。
对了，还有李建良和牧野留姬。因为牧野留美子的名气，找到牧野留姬的住址很简单。倒是李镇宇一家迟迟没有消息，让陆峰纠结了好一会儿。
咚咚咚咚~~~·
放学的钟声响起。
陆峰和武之内素娜找到松田启人的时候，基尔兽已经孵化出来。松田启人在中心公园里找了一个僻静的桥洞作为基尔兽的栖身之所。自从有了基尔兽，松田启人放学后都是最快一个出学校，再也不和盐田博和他们玩数码宝贝卡牌了。
话说这种数码宝贝斗牌游戏还是陆峰参与设计的。初中的时候，一个高富不帅的同学曾话费一个小时来教陆峰玩数码宝贝卡牌，可惜他实在是朽木不可雕，宁愿去玩游戏王，不过基本规则还是记得的。