学园都市,面积占据东京都西部的三分之一的都市，居住着230万人口，其中八成（180万）以上是学生，科学势力的代表。
拥有世界上最尖端的科技，一般认为领先外界约30年。学园都市的由统括理事长亚雷斯塔·克劳利花费50年的时间创建，由统括理事会全权管理。
由于技术、研究多数都是高度机密事项，学园都市内的警戒体制非常严格，对人员进出有严格的限制。学园都市是一个由二十三个学区构成的巨大的教育机构的集合体，以发掘超能力而提供特殊的教育课程，主要靠从外部招收学生。
除了教育机构，还有面向学生研究设施，生产、商业设施，国际展示场，国际机场等等在都市内生活的所需要的生活设施都齐备。学园都市的学生，大部分居住在学校的宿舍中，并在各个学校中接受能力开发。学园都市的学生大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（level0）、低能力者（level1）、异能力者（level2）、强能力者（level3）、大能力者（level4）、超能力者（level5）、绝对能力者（level6）.
实际绝对能力者只是理论上存在进化为level6的可能，并没有哪一个角色成功进化为level6。并每隔一定时间会进行身体检查，重新测定一次，但学生中的六成是无能力者，而学园都市中超能力者也只有七人。
除去各种势力云集，打着记忆术、背诵术的口号做幌子，理所当然似的把脑部开发课程排进学校的上课科目之中，这就是学园都市的另一种面貌。“滴滴滴滴滴滴……”
把妹手依旧和他的宠物玩的很happy，一方萝莉控正在和loli培养感情，理事长依旧泡着水槽里，用无数的滞空回线满足着他的偷窥癖。等等等等。
尽管在水面之下，学园都市潜藏着足以让人道主义者为之晕倒的疯狂黑暗，但出于各种原因，至少在表面上，其还是秉承着一个正常的学园般，所有人，持续着他们那偏差值略大的日常。但是这种日常，却在一瞬间被打的粉碎。
“滴滴滴滴滴滴……”在卫星数据监控室，呆呆的看着屏幕上出现的数据，以及疯狂鸣响的警报，终于回过神来的工作员终于回过神，没有任何犹豫，狠狠的一拳砸向了一个红色按钮。
“呜——呜——!!”凄厉的警报声响彻了整个学园都市。
在屏幕上留下了这样的文字：“巨大空间波动产生，能量等级，波及范围无法计量。”
平常的街道，平时的日常，突然响起了喧哗警报打破了这片平静。在街头的扬声器发出了机械的声音。
“警报！警报！现在发布第一级警报，请第七学区的诸位市民遵从风纪委员（judge）和警备员的指示，迅速到最近的避难所避难。”
“啊啊，又来麻烦了吗。不过这一次好像不是能轻松的解决的大麻烦啊。”看着天空中出现的异状。黄泉川爱穗挠挠头发像是很麻烦一样的说道。
但是其他的警备员却没有像她那样的从容，事实上，看着离地面近千米的天空中那团仿佛由无数颜色混杂而成。却又如液体般不断变幻形态的扭曲空间，只要是正常人心里都发突吧。
不过值得庆幸的是，事情并没有向坏的方向发展，在数分钟后，原本混乱到极致的空间曲率一点点的恢复，并且扭曲的空间也一点点的恢复。就在众人放下心来的时候，‘那个’出来了。
在即将闭合的空间扭曲，一架飞行器冲了出来，但那恐怖的速度与其说是飞行还不如说像是一个被孩子玩腻了而扔出去的玩具一般。
带着巨大的冲击力，飞行器狠狠的撞到地面。爆发的力量简直像是被导弹轰炸一般将地面砸出了一个好几米深的大坑。
最先回过神来的是黄泉川，对着通讯器大吼道：“立刻把救护车叫来！另外扩大警戒范围，通知上层询问接下来该怎么做。其他人跟着我过去看看！”穿戴好了繁琐而厚重的防护服，他们开始向那个砸出的大坑下走去，当真正看见这场事件主角的全貌的瞬间，他们即使连呼吸都几乎忘记了。那是与地球的战斗机颇为相似的形态，整体的形状以流线型和直线形相互融合组成，机体的通体上下布满各种各样的奇妙字符。一道透明的光幕以完美的正三角体环绕着机身缓缓旋转。
明明是明亮到耀眼的银色涂饰，却没有半点庸俗感，反而给人一种神秘与优雅的感觉。通体上下没有半个人工的痕迹，只让人想到了天衣无缝这个单词。到极限的程度省却掉浪费，独一无二的完成体。这是看到了这架战斗机后，所有人对其抱有的看法。
那太过异常的出场方式，明显和地球不同的技术水平，这一切都导向了某个结论，一个年轻的男子喃喃出了所有人在心中冒出了那个熟悉而又陌生的单词。
“外星人。。。。。”
被这个太过惊人的事实所震惊的他们，并没有发现如图纹般遍布整个机体的线条正在一个个亮起。
“sd－－－－脱出异层次元………进入常规世界”
“sd－－－－自检中………检测完毕－－机体完好度98.4％，武装储量32.7％。”
“sd－－－－主体检测中……思维波活跃频率低于限度c，身体受损度超过s级，根据设定逻辑判断，现由本机暂时行使a级权限。”
“sd－－－－