由于东西方经济文化的交流传播，西域的农作物像胡麻、蚕豆、石榴、大蒜、葡萄、苜蓿等先后传入内地，被誉作‘天马’的大宛马、乌孙马和各种毛皮也通过丝绸之路，源源不断地进入到中原地区。
同时，中原地区的丝绸和丝织品也传入西域并西传到欧洲。此外，伴随着屯田士兵传入西域的还有先进的生产工具和农业经验，如铁铧、铁锄等铁制农具及代田法，还有掘井技术和冶铁技术等。
东汉刚刚建立的时候，没有精力管理西域。开始想通过莎车来控制西域，达到对抗匈奴的目的。但是，西域各国不满莎车的奴役和侵凌，都投靠了匈奴。
公元73年，东汉汉明帝派遣军队走出塞北，打击匈奴，又派遣班超到鄯善、于阗用计杀死了匈奴使者，设置了西域都护，恢复了对西域的统治。
公元76年，焉耆、龟兹攻陷了东汉的西域都护。东汉皇帝只好放弃了西域。
公元91年，东汉军队在阿尔泰山大败北匈奴，重新设置西域都护，任命班超为都护。
公元94年，班超攻破焉耆。西域50余国全部归属汉朝。
106年秋天，西域诸国又背叛了汉朝。汉朝皇帝以‘西域阻远，数有背叛，吏士屯田，其费无已’为由取消了西域都护。北匈奴趁机收复了西域诸国。
127年，汉朝又夺回了西域诸国。
到了后来，隋朝从突厥人的手中夺取了西域的东部，又消灭吐谷浑，把行政区扩大到今天的若羌、且末和青海湖西、兴海县以东的一带，设立了鄯善（即今天若羌县）、且末、伊吾三郡。
640年，唐朝军队占领了高昌（即今天的吐鲁番），设置了西州，又在今天的吉木萨尔县设立了庭州，在高昌设立了安西都护府，后来改为安西大都护府，统辖龟兹——今天的库车、疏勒——今天的喀什、于阗——今天的和田、碎叶——今天苏联的托克马克一共是安西4镇，管辖范围相当于今天的新疆和苏联的哈萨克东部、吉尔吉斯北部的楚河流域。
656年至664年这个期间，武则天辅佐唐高宗垂帘听政，发动了一系列对西突厥的远征，一举消灭了西突厥，占领了西突厥的全部领土，辖区扩大到今天的阿尔泰山以西到咸海及帕米尔高原的东西各部，直至阿姆河两岸的诸城邦国。
670年，吐蕃——就是现在藏族的祖先攻占了安西4镇。
693年，武则天再一次占领了西域。
8世纪中叶，安史之乱发生的时候，吐蕃在30年时间里逐步控制了天山南部和河西走廊的广大地区，甚至在763年洗劫了唐朝的首都长安。
同时，回鹘人控制了漠北、漠南甚至到中亚的广大地区，包括新疆的北部。
9世纪之后，中原王朝无暇顾及西域。西域出现了几个国家并列存在的局面，其中主要有高昌、喀剌汗王朝和于阗等地方政权。
10世纪和11世纪，喀剌汗王朝控制了今天的新疆西部。同一时期，一支回鹘在新疆的中部定居。
辽国覆灭的前夜，耶律大石率领部落西迁，在占据西州回鹘和喀剌汗国旧地以后向西扩展到阿姆河流域，建立了西辽政权，疆域包括天山南北、帕米尔高原以西至咸海以南的阿姆河西岸、巴尔喀什湖东北至蒙古西部。
蒙元时期，西域的大部分地区为成吉思汗二儿子察合台的封地察合台汗国。另外，元朝在今天的伊犁河流域设置了阿里麻里行省，又在阿姆河南岸设立了行省，还在今天乌鲁木齐一带设置了别失八里行省。
明代的时候对西域的管理退缩到哈密一带，设立了哈密卫，任用当地的世族首领为各级官吏，统辖当地的军政事宜，维持商贸通道的安全，对西域地区实施委托管理。
15世纪中叶，吐鲁番开始强大，攻破了明朝的哈密等卫所。明朝一退再退，最后退到了嘉峪关……”
于老师端起搪瓷茶杯，喝了一大口水，看着车窗外面的景色，继续说道：
“大清王朝建立的时候，西域还在蒙古准噶尔部的统治下。
1697年，清军终于打败了强大的准噶尔部，控制了西域的东部。
到雍正皇帝的时候，西域和云南、四川、贵州等新纳入清朝统治之下的地域统称为新疆六厅。
1757年，清朝彻底平定了准噶尔叛乱。乾隆皇帝把这片土地命名为新疆，意思是故土新归。
南疆的维吾尔人趁着准噶尔灭亡开始强盛起来了。白山派的首领大、小和卓先后起来反叛清朝。
1759年，清朝平定了叛乱，从此完全稳固了清朝对新疆的统治。
1771年，蒙古土尔扈特部落在首领渥巴锡的带领下，冲破了沙皇俄国的阻拦，从几千里外的草原回到了新疆。
哈萨克的大、中、小3个玉兹先后表示归顺清朝，部分牧民迁徙到阿勒泰、塔城、伊犁地区放牧。浩罕、巴达克、帕米尔、布哈尔、山克、塔什干、爱乌罕等国家纷纷归附大清王朝。
第一次中英战争以后，清朝日益衰弱，中国的领土主权遭到帝国主义的践踏。与新疆相邻的沙俄开始蚕食和侵占新疆的领土。
19世纪中叶，俄国威胁到清朝的整个北部边境，迫使朝廷签订了丧权辱国的《中俄北京条约》、《中俄勘分西