11月9日，孙文从梧州发来电报，说已决定于15日到桂林督师，组织北伐，请蒋志清“节哀速来臂助一切”。
蒋志清没有理会。
孙文又给蒋志清去电，说作战计划已经电告廖仲恺和汪精卫，希望等蒋志清回来后再一起商榷，请他立即偕同戴季陶一起来桂林。
但安葬母亲的日子已经临近，蒋志清哪里走得开。
11月23日，将母安葬。墓碑为“蒋母之墓”四字，系孙文所书，上端扇形栏刻“壸范足式”四字，也是孙文亲笔所书。两旁石狮相对，左右“别头柱”刻蒋志清自撰写的对联，上联为“祸及贤慈，当日顽梗悔已晚”，下联是“愧为逆子，终身沉痛恨靡涯”。墓志是胡汉民做的，铭文是汪精卫所撰，而由沈伊默书写。陈果夫、戴季陶、居正等国民党要人专程来到溪口。
丧事已毕，蒋志清在11月28日邀集亲戚，商议与毛氏离婚之事。但大家七嘴八舌，事情没有一点眉目。最终蒋志清不得不跟母舅孙大吵了一番，才说服他支持自己离婚。但蒋志清也不得不接受毛氏提出的苛刻条件，就是她永远要住在蒋家。
此后蒋志清又耽搁了很多天，每日都是在母亲的墓前做监工。监工是很有必要的，因为有一天掘土工人竟然在墓侧挖出一个空穴。显然乡人都知道这里是溪口的风水宝地，因此也想盗葬于此。蒋志清连忙让人将那空穴填平。
12月。孙文在桂林设大本营，筹划北伐作战事宜。革命元勋李烈钧也正式归队，被任命为大本营参谋总长。孙文同时任命朱培德为滇军司令、彭程万为赣军司令、谷正伦为黔军司令。陈炯明仍为粤军总司令。
蒋志清闻讯，不禁摩拳擦掌。既然后顾无忧，正可大干一场，于是再一次上路了，来到广州孙文的身边。
孙文致电陈炯明催付北伐费400万元，陈炯明电复只能给200万元，而且还要等北伐军出发后再交。
孙文看到这个电报后极为愤怒。想罢了陈炯明的职。胡汉民唯恐事情闹大、造成分裂，因此竭力调停。
孙文与陈炯明多次商谈，请求他切实接济饷项。陈炯明见孙文真的领着几万大军离开广东。足见北伐决心，因此没再拒绝，答应尽力筹饷。但孙文没有得到陈炯明一粟一弹的接济。
孙文愤道：“我已立誓不与竞存共事，我不杀竞存。竞存必杀我。”
激愤之下。还掏出手枪交给黄大伟，令其剌杀陈炯明。黄大伟的脸都吓白了，哪敢应命。
在孙文的催逼下，联络官之一的邓铿向陈炯明作了一次最后的尝试，他对陈说：“我是你的表兄弟，所以敢向你直说。当初你曾答应过孙先生，要供应武器军火，全力支持从事北伐讨逆。但是现在你却自食其言，一个个星期让他空等。你是想阻挠北伐吗?如果不是。那么你究竟目的何在?”
“你不必为这事担心，请镇静下来。”陈炯明直率地说。
“但是我是你的联络官，是你派的，我怎能不担心?我认为你的态度错了。如果你反对孙先生，那就拿出男子汉的气概，照实说出来！你知道你正在愚弄我们这些人吗?”
“你既然逼迫我，我愿意老实告诉你，我何以不送补给。”陈炯明忿然地说，“大总统没有资格组织北伐，我已决心不给他任何军火、经费或供应品！”
“这是为什么?”邓铿问。
“因为他听信那个姓蒋的浙**的煽惑，那家伙要缩减我的权力，撤我的职。”
“这不可能，我不相信。”邓铿叫着说。
“你看这个报告！这就是他写给大总统的原来文字！”
邓铿接过那张纸，看见上面写道：依照目前广东的情势，你作为我们的领袖，只能希望陈炯明不致越权行事。对于他正在扩张中的势力，你必须予以缩减，甚至应将其撤职。如果你希望他于紧急之时，接受你的命令，尊敬本党，并为本党抗御党的敌人，你将会发现他绝非其人。你切不可信任他。我冒昧向你吐露我内心所思，恳祈信之。
“这就是此项阴谋的再一个报告！你以为我会拨出枪炮军火，使人用来对付我吗?”陈炯明问道。
邓铿无言以对。他亲眼看见陈炯明已翻脸决裂，情势无望，就采取独立行动。为求不使孙文失望，他跟几个朋友进行接洽，并且去香港和一家名为辛浦森洋行的进口商签立一项合同，订购一大批武器军火，备供孙文之用。但是，当邓铿拍电报给广州海关，请求准许这批货进口之时，行动计划遭泄。
陈炯明将这事认作危害他生命的阴谋，为报复之计，就命令手下秘密查出邓铿返回广州的日期，并在火车站的入口处刺杀邓铿。邓铿胃部被子弹射穿，送到医院救治，于23日早晨五点去世。
闻之这一噩耗，孙文悲极而泣。
3月26日，孙文召开紧急军事会议，闹到这个地步，孙文面临着艰苦的抉择，当晚便问计于蒋志清。
“陈炯明意图谋叛，逆迹已彰，不如尽速讨伐。攘外必先安内，不清内患，何图中原？”蒋志清毫不犹豫地说道。
孙文沉吟半晌，道：“竞存与我是主张之争，不是主义之争，更不是权力之争。谭延闿他们搞联省自治，是为了割据自固。他要搞自治，是糊涂。但我不能因为主张不同，就跟他开仗。眼下张作霖就要起兵了，我们与之配合，哪里有时间先对付陈竞存。”
眼见与陈炯明闹到这步田地，孙文竟然