一面是这些心理上的准备，余晨亲自带领的军法部门以整顿军队赊欠帐为理由，在各部队中整顿。由军法处牵头，商贩们胆子也大了不少。而且南京新军毕竟有前任的底子，军纪尚可，各汉人部队倒也轻松的还清了欠款。
这一年多来，旗人已经从各部队里头被拔走，完全自组一标。越是被孤立，旗人倒也越抱团。越抱团，就越能感到绝望。南京的旗人有三万多，平素里主要靠当官当兵，北京旗人的臭毛病，南京旗人一样都不少。借钱赊账那是再平常不过的事情。到了满清王朝覆灭的这个时候，旗人反倒是更加要赊账。他们就是抱着有今天没明天的心态，寅吃卯粮的时候更要赊账。
余晨命他们清欠，旗人哪里有钱偿还，冲突自然不会少了。在这时候，余晨毫不手软，更没有息事宁人的打算。
在南京的旗人将军乃是江宁将军，全称镇守江宁等处地方将军，为清代统领江南驻防八旗军兵的最高统帅。现任江宁将军诚勋已经看出事情不对，可是此时能说上话的江苏巡抚王有宏已经到了北京。
5月5日，余晨就在旗营大门口把拒不还债的二十名旗人士兵当众杖责。诚勋见余晨“逼迫过甚”不得不亲自出面阻止此事，结果被余晨当面呵斥道：“军纪之事，上行下效。你身为江宁将军，不能约束旗人军卒，反倒祸害百姓，你该当何罪？”
军法官级别不过是一个副标统，离着江宁将军差了七八级之多。被余晨这么一通怒斥，63岁的诚勋第一反应就是茫然，接着就是大怒。他可是当过江苏巡抚和安徽巡抚的。哪里能被这么一个小辈欺到头上。诚勋的亲兵们刚想动手，余晨的手下早有准备，他们拔出枪来就把诚勋的亲兵统统给打死了。
“诚勋，你纵容手下谋反，该当何罪？”余晨冷静的问着眼前这位曾经大权在握的旗人高官。
诚勋到此时才明白这一切是早有预谋的，老头子当即破口大骂。
余晨也不生气，只是命人拖了诚勋出了旗营，而新军其他部队已经把旗营紧紧围住。
“吴一达这狗贼在哪里？让他出来见我！”诚勋老头子连声喊道。
吴一达自然不会出来见诚勋。这时候已经是图穷匕见的时候，剿灭旗营是王有宏走之前定下的计划。若是吴一达能干好，自然能飞黄腾达，与诚勋这老头子较真有何用处。
余晨命人把诚勋脱的只剩条裤子，然后绳捆索绑的押上囚车开始游街。在游街队伍前，十几个大嗓门的士兵高声宣布诚勋的罪名，“纵容旗营属下敲诈勒索商贩，军法处为南京商贩索回欠款的时候，诚勋意图谋害军法处军官。”
旗人本来名声就不好，加上大家都知道满清马上就要完蛋。此时能看到这位光了脊梁的满清将军游街示众，群众先是惊讶，接着就欢声雷动了。有些被旗人赊欠极多的商贩还用菜叶石头投掷诚勋。这真的是一场令人开心的大游街。
诚勋一开始还大骂余晨是反贼，被下头群众一通乱砸，他忍不住骂了下头百姓是反贼。余晨为了体面可以不还口，百姓们可没这么多顾及。“你才是反贼！”有百姓喊道。
“杀了反贼诚勋！”
“杀了旗人诚勋！”
“杀光旗人！”
口号声越来越响，越来越有倾向性！
南京满城百姓的情绪都被煽动起来。游街完毕，诚勋就在旗人聚居的王府园口将**上身的诚勋当众吊死。随着断气后诚勋的屎尿顺着裤管哗哗而下。围观的群众更加兴奋的高喊起了杀光旗人的口号。
诚勋最后也没有落一个全尸，他死后脑袋被砍下，挂在太平门口，旁边的告示上列了诚勋的诸多罪状。5月8日，国会定国体为共和国，满清在法律上被终结之后。
吴一达要求被围困了数日的旗营官兵放下武器投降。不过处死诚勋的事情已经让旗人再也没有了退路，战斗就爆发了。吴一达早就安排妥当，旗营根本没有什么弹药。新军先是炮轰旗营，接着一路杀进去。上上下下被杀了个精光。
听到枪炮声，早就绝望的南京旗人认为汉人的屠杀马上就要降临到他们头上，这些人拿出准备好的毒药纷纷服毒自尽。
经统计，1911年5月15日，曾经有近四万旗人的南京城，剩下的不足三百人。
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