按照混沌小丑皇的报告来看，似乎打败千年兽之后新生的urd层又有两大新势力崛起，一是陆峰已经知道的“暴龙改造者”，二是一个很神秘的自称“**”的家伙。
暴龙改造者在数码世界各处奴役数码宝贝修建黑暗之塔，凭借黑暗之塔和黑se魔轮的力量，势力范围急速扩大。相比之下**就要低调地多，他似乎是大量收纳黑暗系的数码宝贝，走jing兵路线，虽然地盘不大，却胜在稳扎稳打。
而urd老牌势力似乎都“行动迟缓”，神圣天使兽执掌文件岛开始之街，他倒是想干预这两个黑暗势力的扩张，可惜敌人对他非常了解，每每他主动出击都无法找出对方所在，无法从根本上解决问题。而除他之外，文件岛的高级战力可谓是严重匮乏。超级安杜路兽执掌机械领域，没有陆峰的命令，它是不会理会大陆上的其他事情的。天使之塔的神龙兽见首不见尾，人不犯我我不犯人。那由前代被选召的孩子的搭档数码兽进化而成的四圣兽更是早早消失，甚至取走了第一代主角们的徽章来维持数码世界的平衡。剩下的其他几方几乎是一触即溃，虫之领域的古加兽、火之领域的火焰兽、魔王领域的基米拉兽……全都不是暴龙改造者和**的对手，纷纷败北丧师失地。（urd层目前的地形承接游戏“数码兽大冒险02d－1训练师”中的设定）
在这种情况下可以预见，新一轮的“被选召的孩子”就要诞生了！那么在剧情被陆峰搅得一团糟，或者说因为平行空间全部合并而变得很奇怪的主世界里，井上京和火田伊织他们还能被选召吗？
陆峰只是零散地看过几集第二部的动画，所以有些担忧。但如果是看完了的，就知道被选召的孩子只可能是这几个人！因为能在黑暗之塔下进行装甲进化的必定是与古代中有关联的数码兽，而又这种资质的数码宝贝和人类小孩都是屈指可数。像麻鹰兽和穿山兽甚至是特别为了古代装甲而制造出来的数码宝贝！
排除杂念，陆峰又想到，如果不是井上京和火田伊织没有被选上，那他能不嫩让他们“选上”？玄内能做到的事情，没理由他做不到啊！想到就做，对于古代装甲，陆峰绝不陌生，要知道他在数码世界出生的年代，可正是古代装甲大行其道的时代！他手头还有第一代神圣计划和第五代digivice的详细数据，还有一部分第三代弧光机的资料。甚至还通过泉光子郎搞到了一点武者勇治的老式摇摆机的资料！一切具备，有多尔芬带头，制作出足以乱真的第二代d3暴龙机毫无问题。
就在陆峰兴致勃勃地为数码宝贝第二部准备的时候，暴龙改造者终于侵攻到了亚古兽和迪路兽居住的森林，由此惊动了八神太一，然后首先得到消息的武之内素娜急匆匆来找陆峰了。
于是在各种因素的作用下，比原本的时间提早了大半年，数码宝贝第二部的剧情在urd曾正式展开！