可能又有人会问，为什么印尼政府单单针对华裔？印尼独立后华人为印尼经济建设做出了卓越的贡献，在长期的经营中华人群体积聚了大量的社会财富，控制了印尼私人经济的70％，特别是在工商业方面。然而印尼拥有1.6亿人口，华裔只占印尼人口的不5％，因此各群体间巨大的贫富差距必然会导致相互间的对抗。
在法制上，印尼政府对华人设立了一些歧视性的法律法规。1945年的印尼宪法就明确规定，印尼总统必须由原住民担任，这具有浓重的种族歧视意味。1967年印尼政府相继颁布了一些专门针对印尼华人的法律法规，比如禁止华裔使用华语，限制华裔宗教和文化习俗、更改华裔的族群称呼等等，总共有14项之多。但是其中影响最为深远的几条是：禁止使用华语并禁止出版华语报纸书刊，禁止华人成立公开的社会政治团体。这直接导致华人参与印尼政治生活的道路被堵死。一旦发生社会动荡，政治上无权的华人便遭遇灭顶之灾。
其次，说说印尼的政治体制。一九六五年,一群印尼军人发动流产政变，印尼政府借口印尼**参与此事，开始大肆屠杀**人。之后印尼军人集团长期掌权，实行**统治，靠军人集团支持的苏哈托执政印尼长达32年，长期的**统治必然会导致各种各样的弊端。尤其在国家法律法规的制定方面表现的尤为明显。以上针对华人的14条就是印尼政府有意无意针对华人而设立的，而苏哈托本人对印尼**人以及华人的厌恶也催化了这些条例的施行。
**体制同时也决定了这种统治政策存在极大的不稳定性，当社会动荡时，由于国家政权是由利益链结合起来的由一人**的联合体，各利益团体必然会产生间隙，而导致国家的统治工具的弱化，这种状态下，对国内局势动荡的控制能力必然弱化。
经济分配的不均衡导致的民族问题也是导致印尼华人悲惨遭遇的一个重要原因。印尼国内种族烦杂，但是泛印度尼西亚人占全国人口的绝大部分，而人口 多万的印尼华裔只占全国人口的5％，而这些华人控制着印尼国民经济的30－40％，私人经济的70％，在印尼经济生活中发挥着举足轻重的作用。这种利益分配的不均衡往往成为印尼原住民排华的借口，同时，少数无良政治家也利用这一点安抚占全国人口大多数的原住民，将人民斗争视线引到华人身上。
同时，印尼政府有意无疑地进行对华裔的负面宣传，使得华裔和原住民互相产生了不信任感。印尼政府夸大了印尼华裔对印尼经济的控制力度，使得印尼原住民认为印尼原住民的普遍贫穷罪魁祸首是掌控了国民经济的的印尼华裔团体。
而华人对自己没有获得印尼基本的国民待遇也深感不满，造成了民族间不安全感的产生，民族隔阂形成。同时值得提及的是：1945年印尼在政治上获得了独立，但是印尼上层人士普遍认为印尼的经济并没有独立，政府只是控制了国民经济的50％，大部分私人经济和国民经济的30－40％掌握在华人手中。因此，印尼原住民强烈要竟的经济命脉，使华人成为本地人的雇员?
98年的金融风暴催化了印尼国内的政治经济危机，原住民生活状态进一步恶化，政局持续动荡，民众对政府的不满情绪也日益深化。大企业集团纷纷破产，贫困人口占到全国人口的一半以上，同时国际货币基金组织借口印尼改革不利，对印尼的援助迟迟不到位。在这种局面下，社会各界对政府丧失了信息，转而依靠自己的力量为自己寻求更大的利益，少数人特别是**势力利用了这个机会，大肆对华人进行洗劫屠杀。并且印尼军人、警察也参与了这次**事件。
这次事件使得华人的思想开始觉醒，深刻地意识到为了华裔自己的利益，必须提高自己的政治意识，积极参与国家政治生活，他们联合起来建立了印尼大同党、印尼中华改革党等一些政治党派。同时各种华人团体也纷纷建立，而随后的纳土纳事件，更是将华人的这种思想觉醒推到了从未有过的高度。
不但是印尼，在其它的国家的华人，争取符合自己身份的意思也大大提高。只是华人在争取自己权利的同时对各国国内继续存在的排华势力依然不可忽视。