李云聪所说的建议对于项玉来说也有些确实是很有迫切性的，比如逐渐摆脱掉身上的明朝残余的身份，将明朝的烙印去掉才能摆脱掉一些制约，但是这件事情项玉还得多方征求和了解其他人的意见，之前他曾与陈永华有过这样的探讨，陈永华的态度是支持的，毕竟他也曾劝过郑成功自立为王，因此什么正统不正统的他倒不是十分在乎。
这个时候军中的主要的将领都是项玉自己原来的身边的卫兵，除了张聪以外无论是张三亮、邓明、李权、刘阳等人都是大头兵出身的，他们对于明军的身份的认同度也不是多高，可以说肯定是支持项玉的，即使是张聪，他一直对项玉是忠心耿耿的，因此军队里面的问题并不是很大，加上项玉之前在基隆所施行的政策和明朝的旧制有很大的不同，几乎是没有一处是照搬的，不仅名称改变了，而且细分之后各级制度都发生了翻天覆地的变化，这些制度，目前在基隆运转良好，民众们并没有什么不适应的。
加上基隆或者说整个台湾都没有强大的家族势力，这种家族势力说的不是商人世家，而是历史上的一些权贵和文人阶层，他们或许会力保明朝的旧制，但是目前的台湾上这些人实在是太少，少到他们的力量微不足道。
既然如此本着晚改不如早改的原则，那么如今确实是彻底去掉明朝留下的烙印的大好机会，项玉这一次终于下定论决心了。
只是这种事情不是说说的那么简单的，项玉自己目前并没有登基称帝的想法，不是他不想，而是目前台湾的实力达不到那种程度，等到台湾的实力发展到了一定的程度之后，这种事情才显得水到渠成。
十一月中旬，军方由李云聪、张聪等人牵头，凑请项玉改制的事情传遍了整个军中，而这时，基隆的陈永华、秦文等人也联合大小上百名官员上书要求改制，祛除掉已经灭亡的明朝旧制，去掉明朝遗臣的身份，另立新政，这件事情闹得满城风雨，项玉却只是不准，说一日食君俸禄，终身为明朝臣子，不肯改制。
但是军方和政府的代表们再一次强烈要求，项玉又一次拒绝，如此三次终于才肯接受，其实这时古时候的一个既定的套路，不是说必须要如此，但是这样一套下来才会让人觉得你是顺因民意，而不是自己想坐上这一个位置。
改制之后的基隆军队该国号为中华帝国，子民是全天下的炎黄子孙，哪里有汉人，哪里就应该是中华帝国的版图，这一条规定后来直接引发了中华帝国对外的好几场战争，但是制定之初项玉并没有考虑到这个方面，他的主要目标还是回复汉人数千年来的固有领土，那就是神州大地。
如此一来原来明军的称呼也要改为中华帝国军了，只不过这样的称呼实在是太长了，因此项玉将国名简称为中国，而军队也称为中国军队了，项玉自己因为不愿意称帝的关系，所以自称为总督，实际上还是明军和政府的最高领导者，那个时候没有独裁者的这种说法，在普通人的严重，大权独揽是理所当然的，这也给项玉省去了许多麻烦。
改制了之后恰逢军队要大规模扩招，所以项玉在原来的军队制度之上进一步优化，在原来的基础之上将后世的军队编制包括军衔制度全部都引入进来，之前项玉不这么做的原因大多考虑到并不适用，因为战争大多是集团化和大规模的战争，而这个时候明军即将开赴东南亚的热带丛林之中进行征战，这些地区的条件决定了大规模的决战可能不会太常见，而小规模的丛林战则势必会经常出现。
项玉引入后世的一些列的军队编制，这个时候帝国军队的规模只有不到一万人，因此只设立一个师的编制，师长自然是他自己，副师长张聪，全师编为三个团，一团长张聪，中校军衔，编制为两千七百人，下属四个步兵营和一个炮兵营一个团直属连。二团团长张三亮，少校军衔，编制为两千五百人，下属五个营，一个独立混成大队。三团团长李云聪，少校军衔，下属三个营一千六百人的规模。
这个三个团是陆军的编制，一共有七千八百人，每一个团都便有一支炮兵营，军中还有一个独立的炮兵团，团长是邓明，少校军衔，下辖四个炮兵营两千二百人的规模。
海军方面编制为一支基隆海军舰队，海军司令李权，少校军衔，下辖三千六百人规模的海军舰队，一共有一百一十余艘作战船只，海军中间还有一个海军陆战队，编制为一个营，营长刘阳，上尉军衔，下辖七百名士兵。
普通的士兵这个时候也按照军衔来划分，根据兵龄和战功来分，从低到高依次为列兵、士官、尉官、校官、将官、元帅。
其中列兵细分为二等兵、一等兵（上等兵），按照帝国军队的新规定，军中的士兵按照入役年龄第一年为二等兵，第二年则晋升为一等兵。
士兵们这个时候再帝国军中服役的时间都不是很长，因此大多数都是列兵，因此按照军队的规定，士兵们可以通过战功来晋升，达到一定的要求就可以由列兵晋升为士官，士官一般担任排长班长之类的低级军官。士官们也可以由军功和年资晋升为尉官，尉官一般担任连长和营长的职位。尉官向上又是校官，达到这个层级的目前只有五人，其中一名中校和四名少校，这个军衔在后世不是很高的，但是因为帝国之后对外的战争势必是非常的频繁，而且他们五