世界树居住在世界的最顶端，根系蔓延到整个世界。在从整个世界汲取养分的同时，还在监控这个世界。不过这已经是很久很久以前的事情了。那个时候，这个世界连完全体数码宝贝都还没有几只呢。
随着数码宝贝们慢慢进化，整个世界似乎也在成长。在墨丘利兽的记忆里，自己出生的时候，数码宝贝世界只有现在的三分之一大小。
在世界树的掌控下，整个数码宝贝世界都是一副井然有序，欣欣向荣的场景。但是有一天，深海里一只海魔兽突然进化，成为了究极体的达高兽。达高兽斩断了世界树的树根，将大海变成自己的王国。大海从此与陆地断绝了联系。
直到很久以后，一只伤痕累累的潜鲨兽钻出海面，向陆地上的数码宝贝求救，大家才知道原来大海在达高兽的统治下已经变成了地狱。
世界树下达了征讨深海世界的命令。但是战斗却无比的艰难。达高兽的残酷统治对于弱者来说是地狱，但也是强者的天堂。在外界的最强者还是完全体的时候，深海里除了达高兽还有另外两只究极体数码宝贝，完全体的数码宝贝更是不可计数。最后汉克兽在伙伴们的帮助下潜入深海，杀死钢铁海龙兽，斩断了达高兽的触手，为这场胜利奠定了基础。
海底的战争，却为陆地上的数码宝贝增长了知识。很快，在陆地上有许多数码宝贝进化到了究极体。他们也学习达高兽的做法，斩断世界树的树根，在陆地上自立为王。那时候，墨丘利兽已经进化到了完全体，也在计划着未来从世界树手上夺下一片领土。
再后来，世界树发出了战争的号令。数码宝贝们纷纷响应世界树的号召，带领军团向另一个世界发起攻击。但是很快，远征军几乎全军覆没，世界树也受到了重创。世界树将自己还有另外许多完全体数码宝贝召集起来，询问大家愿不愿意保护这个世界。最后墨丘利兽还有另外十一只数码宝贝通过了考验。在世界树的帮助下融合了世界的本源，成长为奥林匹斯十二神。与此同时，世界树的根系重新蔓延到整个世界。
再后来，数码宝贝世界长大了，世界树也无力让自己的根系蔓延到整个世界。于是世界树将奥林匹斯十二神派遣到数码宝贝世界的角落里，代替自己控制数码宝贝世界。
到了今天，世界树已经不在数码宝贝面前出现了。就算是奥林匹斯众神也不能直接接触世界树。黄金剑狮兽也是生存了很久很久的数码宝贝，他很清楚，虽然眼前的战局十分艰难，但也只是十几只究极体数码宝贝的小打小闹。这是无法引起世界树的关注。但是与此同时，黄金剑狮兽也能感受到敌人的强大，可是一个可以颠覆数码宝贝世界的存在。面对这样的对手，矜持和骄傲都是在自掘坟墓。
“拜托你了，替我们向世界树求援吧。敌人的强大，是前所未有的。”面对强大的敌人，黄金剑狮兽也不得不低下自己骄傲的头颅。