当小樱、当麻、土御门、神裂、米夏在学园都市内“兜圈子”的期间——
美琴得知菲布理是人造人，之后小樱和其他妹妹又被“上级”叫去做“黑暗”的工作，拜托大家照顾菲布理后，美琴心中那个恨啊，已经难以隐藏在心里了，连朋友们都看出了她的状态不对。
经过自我心理的激烈斗争和朋友们的劝告后，美琴约了还不知道真相的黑子、初春和泪子，向她们坦白了实情。虽然大家的样子变了，可认知没变，所以完全无碍。
“诶？！”
“菲布理，和美琴学姐的妹妹们……都是人工制造的？”
“连警备员也无法出手，真的存在这样的组织吗？而且连美琴学姐的妹妹们都是这种组织的人…………”
“菲布理没有那糖就活不下去什么的…………”
“我想，有。”美琴说道，“之前我为了妹妹们的事情，和她们接触过，是群非常危险的人，结果，我什么也没做成，最后还是靠妹妹们才摆平了事情，后来的‘幻想御手’、‘乱杂开放’事件也是，我真是个没用的姐姐，不是吗？
“菲布理的话，现在虽然有克洛伊的投影帮忙维持，但只能确认构成，制造方法却不详，并非长久之计，要救菲布理，就必须置身于如此危险之中。希望你们了解这点，说实话我不希望大家涉险，老实说，我不知道能否保护好大家…………”
不过美琴也只承认了已经认识的五个妹妹，两万个怎么说都太骇人听闻了？令美琴始料未及的是，大家马上就开始讨论起应对暗部的策略来了。美琴对此非常感动。
之后，初春和泪子前往风纪委员支部做进一步调查，美琴和黑子则到警备员那里了解一些情况——
“需要那些驱动铠和警备机器人，以及要见见上次抓到的犯人吗？”黄泉川说道。
“嗯，要了解一些情况。”黑子说道。
“抱歉，东西都被上级收走了，犯人也因为没有证据，又迫于上级压力无罪释放了。”黄泉川叹气道。
“诶？但是，有了这么多证据，怎么会无罪？”黑子不敢相信。
“那些机械都没有电子系统，收缴的计算机也是一启动就被自动清空了数据，被摆了一道啊。嘛，那边肆意妄为也不是一两天了，我们不是没调查，但几乎一无所获。”
最后，美琴和黑子只从黄泉川那里得到了一个装有丝状物的零件作为线索。给冥土追魂分析后，得知是菲布理相同个体的头发，但没有进一步线索了。
无奈，在托了冥土追魂的关系后，美琴见到了正在被监禁的泰瑞丝缇娜。在一番舍弃尊严的死缠烂打后，得知了“生化智能（cal-roid）计划”和该事件和学究会有关的事实。
根据该线索，初春查到了暗部“udycorporation”，包括其在第十七学区的工厂的地址。
调查到此，一天已经过去，美琴决定次日亲自去这个工厂进行调查，毕竟这是现在唯一的线索。
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深夜，视线转到，御坂樱视角——
白天对当麻的老师同学的调查无果，天色暗下来后，便准备各自回到落脚点或公寓了，毕竟有些事太急也无法完成。
但是，过了大约午夜，神裂和土御门却再次被小樱召集到了大众餐厅。
“御坂小姐，你叫我们来有是什么新发现吗？”神裂很认真地问道，虽然小樱的表现一直以来都是对魔法一知半解的样子，但从拯救茵蒂克丝的表现看，小樱的话还是很值得一听的。
“之前说过，天使坠落的副作用只有施术者本人才不受影响，是吧？御坂樱在此确认。”
土御门和神裂点点头。
“我们在市内调查的同时，为了提高效率，我让妹妹们去调查了一下上条同学的家人（黑客技术查找户口信息并黑掉学园都市外围防御系统后实地走访），发现只有他的父亲样子完全没变（照片比对）。御坂樱在此告知。”
“你的意思是说，阿上的父亲就是施术者喵？”土御门道。
“问题是，上条同学也说过，他的父亲上条刀夜是普通人。但是，当初救茵蒂克丝那段时间，我和上条讨论时，他提过小萌老师曾经用普通物品摆魔法阵给被神裂砍伤的茵蒂克丝施展治疗，那么，上条刀夜是不是有同样方式呢？为此我让妹妹们调查了这两天上条刀夜到过的场所。这是我妹妹们在实地拍的照片——”
说着，小樱拿出了半小时前御坂19191送到的照片，都是拼接过的三视图，包括办公地点、旧房子、新房子。
其实小樱对这类仪式场有所了解，虽然体系不同，但灵梦、早苗、帕秋莉、八云一家都会这类东西。征询神裂和土御门的意见只是装模作样。
“是这个喵，”土御门肯定地指了指上条新房子的图片，“房间四方，青龙、白虎、朱雀、玄武的代替品，以及三千个护身符摆放在相对应的位置，毫无疑问，已经构成了仪式的神殿。”
“我知道了，”神裂拿起七天七刀准备起身，“上条刀夜的就交给我来处理。”结合目前的情报，当下确实是由她这圣人料理最为合适，对方虽然是普通人，却构筑如此规模神殿，不知还会什么仪式魔术。
“等等，我还没说完！”小樱举手示意神裂坐下。
“还有一件事情，方才我也准备把另外两人叫来的，但是，上条同学不知