但生化试验失败，导致一种致命的t病毒的意外产生和泄漏。
“红后”，一台控制和监视着整个“蜂巢”的超级巨型计算机把整个中心都封闭了起来，甚至包括很小的漏洞，“杀死”了所有被困在里边的工作人员。
“保护伞”公司，雇佣成立了ice)特别战术营救小队，突破“红后”的封锁，打开了“蜂巢”，而导致了t病毒的外泄爆发，并快速地传播着。
就在一夜之间，这种t病毒把整个浣熊市变成地狱，生还人数更加从原先的10万多人，下跌至不到3；其它城市……
“当时，那队人员，就有我们的本体爱丽丝，保护伞公司解救后，本体被提取了基因样本，制造了我们这些复制体！……”
“……本体爱丽丝，成功逃脱研究所后，与保护伞公司展开了对抗……”
“后来，本体找到我们，与我们联手击退了保护伞，抵御住了他们的核弹攻击……却被从沉睡休眠中忽然醒来的‘红后’操控‘蜂巢’系统偷袭，与两千多姐妹一起，昏睡封印在地下蜂巢内……”
“我大致上明白了。这一切都是保护伞公司搞的鬼。它最新的研究方案失败的意外成果——变种t病毒造成的结果。解决末世根源，便是研制出克制这个病毒的反病毒。最有效办法就是利用遗传上的变种试验……”包辉点点头：“一旦解决了根源问题，‘红后’的执行命令被解开，会主动释放本体爱丽丝的。我现在缺少的是t病毒原液的样本，或者是生化试验方程式……”
他的话，让一众爱丽丝复制体，全部眼睛一亮。
“原本我们是想要借助你的强大兵器，来打开地底蜂巢的封锁。”103号爱丽丝欣喜道：“没想到，你还是基因遗传学方面的的专家！太让人惊喜了，你是上天派来的救世主么？”
数百爱丽丝复制体，齐声赞扬。
包辉面上微微一红，他只是理论知识丰富，生化基因实验，他一次也没有接触过。
“借用我的灵剑！你们的本体困在蜂巢里了？”他随即反应过来。
爱丽丝复制体，彼此互相看看，对于他快速反应过来的强大推理能力，都有些惊异和欣喜。找到他这样一个实力强大、推理分析能力突出、智多近妖的“队友”，实在是意外之喜。
一些复制体，快速动了起来，不一会儿，她们将一台笔记本电脑界面打开，推了过来。
103号爱丽丝期盼地说道：“黑！你加入我们，一起行动吧。这是t病毒原液的试验所有数据，你要的方程式也在里面……”
“消耗10万功勋值，解析t病毒信息……改进解毒试剂方程式如下：……，最终分析建议结果：收集t病毒原液样本，找齐始祖病毒、变种laa病毒、维罗妮卡病毒……；融合提炼出终极t病毒原液，可以解除宿主身上的第三代变异t病毒，将有一定几率获得基因进阶能力……”
包辉心中一喜：“终于能够解毒了，这什么进阶能力，我倒是不敢想象的！”
“始祖病毒一：非-洲‘太阳阶梯’花的花粉毒素……”
“始祖病毒二：古生物‘女王蚁’的基因中的一种古代病毒……”
“laas的毒素……”
……
这些病毒线索，都涉及到保护伞公司。一旦打开地下蜂巢，一切都能够验证清楚。
包辉轻轻呼出一口气：“好，我答应加入。”
“激活隐藏任务：爱丽丝的求援。解救困在浣熊市原保护伞公司总部地下‘蜂巢’的爱丽丝本体，成功，可有50几率获得爱丽丝的基因能力；失败，100困死在‘蜂巢’……”