这三个部落留在中原的成员在商周时建立苗、邓（湖北襄樊市西北部，周初北狄族的姜姓土方取代了子姓的邓，周昭王前，又被曼姓取代）、曼、蛮子、尢、丹、黎、酄等小国。
《五帝本纪》汉代郑玄注曰：“苗民，谓九黎之君也。九黎之君，于少昊氏衰，而弃善道，上效蚩尤重刑。必变九黎，言苗民者：有苗，九黎之后，颛顼代少昊诛九黎，分流其子孙为三苗国。高辛之衰又复九黎之德，尧兴又诛之，尧未在朝，舜臣又窜之。后禹嗣位，又在洞庭逆合，禹又诛之。”《韩诗外传》卷三：“当舜之时，有苗不服，其不服者，衡山在南，岷江在北，左洞庭之波，右彭蠡之水。”（《说苑·君道》有类似记录。）可见经过颛顼、尧、舜、禹的多次征伐，一步步把三苗赶到西南蛮荒之地。三苗的一部分融入尧舜禹部落中，而“三苗”西北部一部分则发展为荆蛮，后建立了楚国；后来楚国的大部分人都融入华夏族群之中。三苗的大部分分别向西、向南、向东南迁入山区，形成苗族、瑶族、畲族。苗族公认祖先为蚩尤。后来又从荆楚地区西迁南进，分散在西南边疆云南、贵州、四川的山区甚至南迁到海南岛和东南亚的不少国家之中。西到前藏、伊朗和阿富汗。他们中还有一部分融入了北方诸如北狄、匈奴、鲜卑等民族中，最后又融入华夏民族中。所以说，华夏民族，更准确地说中华民族就是以黄炎联盟为核心，先后融入了“九黎”、“东夷”、“北狄”、“鲜卑”等众多生活在中国大地上的少数民族群体，形成你中有我，我中有你的多元一体格局的大家庭。谁也分不清你是那位始祖的后裔。我们既然承认黄帝、炎帝是我们的祖先，当然要承认蚩尤也是我们的祖先。
西部方言苗族经过四百年前“土人存十之一、二”的平播战争，以及长达六年的“安奢之乱”，相当一部份被迫迁徒去了云南，并在随后两百年内流入了东南亚半岛。上世纪七十年代，随着印度支那局势的变化，十多万老挝苗民沦为难民，最后散布在全世界五大洲10多个国家。中国苗族成为一个世界性的民族。
三苗与尧舜禹的斗争：
尧舜禹与三苗之战共经历了三个阶段：
第一阶段：尧与三苗战
三苗在尧时早已立国。尧时，尧以天下让舜，三苗与尧同为羌人，反对把权力让给东夷族的舜，“三苗在江淮荆州数为乱”，尧发兵征讨，战于丹水之浦。（《吕氏春秋·召类》曰：“尧战于丹水之浦。”）尧曾封子丹朱于丹水，“有丹山，此山出丹朱也。”是丹朱为封地，以封地而名“丹朱”。这一带后来的姬姓国有隋、唐、曾、巴以及熊姓的罗国(后迁岳阳)。丹水流域，即河南西南部和河南浙川西、湖北交界的地方。三苗被打败后，首领驩兜被流放到崇山（“放驩兜于崇山，以变南蛮”），“驩兜”是三苗一支的名称和该支首领的名称，据说就是尧的太子丹，此说恐怕不当。丹朱可能是驩兜失败后由尧封在此的。后来尧禅让给舜，太子丹才与驩兜部联合起来，于是太子丹成为与禹大战时驩兜部落联盟的新领袖。《山海经·大荒北经》：“西北海外有黑水之北，有人有翼，名曰苗民。颛顼生驩头，驩头生苗民。苗民厘姓，食肉。”《史记·五帝本纪》：“昔帝鸿氏有不才子……浑沌。贾逵注：帝鸿黄帝，其苗裔驩兜也。”看来驩兜是黄帝的后裔，厘姓。
三苗部分人众被流放到西北的三危山（“窜三苗于三危”《史记·五帝本纪》）。一般认为三危是地名，即现在的甘肃敦煌一带。
崇山在今湖南大庸市西南，此地属武陵山区，行政建置属湘西土家族苗族自治州。《苗族简史》说，湘西苗族五大姓之一的石姓，与驩兜有亲缘关系。石姓有大小之分，大石姓在苗语中被称为“驩兜”，泸溪、花垣有驩兜墓、驩庙。万历《慈利县志》卷十二：“驩兜墓在崇山，舜放驩兜于此，后遂葬于山下。”即放逐于湘西的山区。驩兜（丹朱）族远达越南中部和广西南部。
第二阶段：舜伐三苗与分北三苗。
相传上古时帝尧因儿子丹朱行为不检，故而把帝位禅让给舜。所谓尧禅让，根据史书及考古发现，实际是舜软禁了尧，《汲冢竹书》说：“舜篡尧位，立丹朱城，俄又夺之。”《竹书纪年》说：“舜囚尧，复偃丹朱，使不与父相见。”《骆史·发挥》引《纪年》：“尧末德衰，为舜所囚。”舜夺取尧的职位后。三苗与华夏集团的冲突进入了第二阶段。
据史书记载，舜为了使三苗臣服，一面发展生产，巩固联盟内部团结，采取了文教感化和武力征服相结合的政策，一面进一步采用分化、瓦解的策略，即“分北三苗”。《尚书·舜典》：“三载考绩，三考黜陟幽明，庶绩咸熙，分北三苗。”《史记·五帝本纪》同。王肃云：“三苗之民有赦宥者，复不从化，不令相从，分北流之。”郑玄曰：“流四凶者卿为伯子，大夫为男，降其位耳。犹为国君，故为三苗为西